a）利用凝胶电泳检测，但是不能精确检测片段大小；

b）利用qPCR检测, 但只能检测事先选定的位点
，并不适合基因组范围的分析；

c）利用电镜检测， 但费时费力 ，效率低；

d）利用大规模测序平台检测；

2. cfDNA相关的分子检测

利用计算窗口化保护评分（windowedprotectionscore
，缩写wps）进行检测，即：片段大小=在基因组里面一个特殊的点内跨越120bp的DNA片段数量-有端点的片段的数量 。它和核小体距离有相关性
。我们可以根据核小体的距离来推测cfDNA的来源。

3. 检测目的

a）检测cfDNA的大小可以知道它是由哪种细胞死亡机制产生的：～10000bp的cfDNA由细胞坏死产生；140-200bp的cfDNA由细胞凋亡产生；313-798bp的为孕妇cfDNA；

b）检测 cfDNA相关分子信号 ，比如甲基化
，以及核小体距离可以追溯它的组织来源；

c）检测特定序列的cfDNA的种类数量的变化可以判断癌症，以及相关疾病 。

血中cfDNA在疾病的早期诊断
、预后、监测等方面具有重要潜在价值
。其具体医学应用大致包括以下方面：

a）用于产前诊断；

b） 用于免疫性疾病等非肿瘤类疾病的病情分析与疗效观察；

c）用于肿瘤相关分析。

在上述三类应用中 ，其在肿瘤分析中的价值尤为重要
，虽然目前血中cfDNA分析尚未列为临床必需的检测指标，但数以千计的研究论文和大量一期和二期临床试验的数据 ，有力支持这一新技术在肿瘤防治中的巨大应用价值：

a）肿瘤的早期诊断；

b）肿瘤治疗方案确定；

c）肿瘤疗效观察；